以大乘佛法在漢、藏二大傳承中之理論系統與發展論述為研究主題，例如：
1. 漢藏佛法之唯識學比對。例如：研究玄奘唯識學與宗喀巴之唯識思想的差異。
2. 漢傳部派佛教與藏傳小乘宗義的比對研究。
3. 中觀思想在漢藏佛教的差異。譬如：漢傳《大智度論》與藏傳《中觀理聚六論》的比對。
4. 漢文與藏文之《法華經》的差異，特別在翻譯方面的文獻比對研究。
5. 漢藏《華嚴經》的文獻比對研究。
6. 《大毗婆沙論》完整翻譯成藏文的可能性。
7. 《解深密經》漢文與藏文的文獻比對。
8. 翻譯學研究，主要針對玄奘翻譯的法相名詞，對應於藏文所翻譯的法相名詞的比對與分析。
9. 針對如來藏之專題研究，主要從藏傳佛教有關如來藏的詮釋，與印順導師如來藏研究的比對。
10. 研究藏傳佛教以「四部宗義」及「了不了義」的途徑，對佛經予以分判決擇的理論，是否有對應於漢傳佛教判教學之功能論。
11. 研究藏傳《量論》相關邏輯，完整翻譯為漢文的方法，特別在文獻詮釋學方面之相關研究。